周永红说，这对基层健康教育机构来说难度很大。由于健康教育工作涉及面广，需要多部门配合，湖北省成立了全省健康教育工作协调小组，由卫生厅厅长任组长，协调和相关部门的工作。但是，市、区（县）级并未成立相应协调小组，健康教育机构对其他机构和部门只能进行业务指导。如果相关机构不配合，工作会面临重重阻力。比如要去学校给学生进行健康教育，没有教育部门配合就不行；要指导医疗机构完成健康教育工作，没有医政部门配合也不行；如果没有卫生监督部门的帮助，在公共场所开展健康教育更是步履维艰。如果市、区（县）能有纳入妇社、医政、农卫、卫监、规财等部门的健康教育工作协调小组，对工作的有效推进将大有裨益。
县区级机构成经费投入盲区
巨大的工作经费缺口是目前基层健康教育机构面临的又一窘境。
湖北省武汉市疾控中心健康教育所所长李俊林说，武汉是省会城市，市健康教育所一年有50万元的专项工作经费、20万元的艾滋病防治专项经费和10万元的血防工作经费保底。但是基层健康教育机构的日子却不好过。这两年，国家的公共卫生经费投入向基层倾斜，直接下发到社区卫生机构和乡镇卫生院。而县（区）一级的健康教育机构成了经费投入的盲区。没有公共卫生经费，却要完成对社区卫生机构和乡镇卫生院的健康教育工作指导和考核，难度可见一斑。
黄陂区是武汉市最大的区，健康教育机构条件相对比较好。该区卫生局辟出了一层楼给他们办公用，办公设备一应俱全。即便如此，该所的28名职工仅8名在编，也就是说，20人的工资要靠自己挣。2009年，该所的财政预算指标为57万多元，但实际支出却高达123万多元。周永红不得不去承接一些别的工作来“挣钱”。
刘兆炜说：“健康教育机构的经费主要来自中央转移支付项目，比如这两年的居民健康素养和控烟，还有省级财政的配套投入，再就是一些临时项目和工作经费。现在的问题是，省财政今年160万元的投入分到181个区（县），每个区（县）能拿到的很少，而中央项目只在部分区（县）开展，大部分区（县）没有这笔钱，临时项目也不稳定。基层的健康教育机构更是陷入了只有工作没有经费的窘境。”
“如果能将健康教育工作经费单列项纳入区（县）级财政预算，就能解决目前基本没有区（县）级财政投入专项经费的问题。”周永红说。
人都不够，素质高更无从谈起
李俊林说，有独立健康教育机构的市县不多，健康教育多是疾控中心下属的一个科室，可能也就一两个人，不少地方甚至没有专职人员从事这项工作，而由其他科室人员兼职。加上编制所限，人手不够一直是一个大难题。